本校創設於台灣日治時期昭和12年(民國26年，西元1937年)，至今已有八十五年的歷史，其間由日治而民國，由縣立而省立、國立，由興農國民學校而實踐農校、初農、高農、農工至今稱之「高級工商職業學校」，畢業生遍及各地，在各行各業嶄露頭角，是彰化西南角歷史悠久的優質學府。

詳誌之，本校創立於民國26年3月31日；初名為「北斗興農國民學校」。民國30年4月，改名為「北斗實踐農業學校」。臺灣光復後，民國35年5月25日改名為「台中縣立二林初級農業職業學校」。民國39年彰化設縣，校名隨之易為「彰化縣立二林初級農業職業學校」。民國43年8月試高級部農藝科，民國44年8月正式改為完全農業職業學校，翌年定名為「彰化縣立二林農業職業學校」。民國55年8月增設工科，10月改制為「彰化縣立二林農工職業學校」。民國57年實施九年國民教育，8月起停止初級部招生，並奉命改制為「台灣省立二林農工職業學校」。民國59年6月原初級部最後一屆學生畢業後，8月更名為「台灣省立二林高級農工職業學校」，並奉准附設高級農工職業補習學校。民國64年8月起農科停止招生，並增設綜合商業科。民國66年6月原農科最後一屆學生畢業後，8月再改制為「台灣省立二林高級工商職業學校」並附設高級工商職業進修補習學校，民國88年9月附設高級工商進修補習學校去補習二字更名為「台灣省立二林高級工商附設高級工商進修學校」，民國89年2月因精省改名為「國立二林高級工商職業學校」迄今。

另隨著國家教育政策的推進，及對特殊教育的重視，本校民國90年8月奉命增設綜合職能科一班，招生輕度智能障礙學生；民國91年8月成立綜合高中學制及體育班，協助學生多元進路的試探與發展，同年亦於彰化監獄設立進修學校分校；99年8月綜合職能科增設為兩班；民國103年8月因應中科二林精密園區的設立，成立機械加工科(實用技能學程)；民國105年8月配合行動菩薩發願成材計畫，調整商用資訊科為裝潢技術科；109年8月，綜合職能科因少子化因素，調整為一班；109學年度為簡化學制並符應社區家長對技職教育的期待，申請通過停辦綜合高中學制，並於111學年度開始停招，進而回歸技術型高中(商業經營科、機械科、電機科、室內設計科等四個科)；110年8月，考量本校師資結構，彰化監獄分班採三年段循環開班方式進行之；112年8月起，考量本校教師授課負擔，實用技能學程裝潢技術科及機械加工科亦採循環開班方式進行之。

本校僻處彰化縣西南海隅，所謂「風頭水尾」，地理環境簡窳，文化資源缺乏。台灣光復後，幸經劉守信、林上、謝悅、宋協邦、林肇家、李啟源、邱榮義、簡顯經、黃清江、陳志福、鄭玉珠、呂勝志(代理)、劉玲慧等歷任校長及歷屆師生的共同努力下，篳路籃縷，披荊斬棘，用心經營，點點滴滴奠立基礎，成為彰化縣西南角重要的技職教育基地。

現任校長丁志昱先生於民國112年8月1日接掌本校以來，深獲全校師生、熱心家長暨諸多校友、地方士紳之鼎力協助，積極打造「以人為本」之教育哲學，培養學生「人要做好、身要練好、書要讀好」之品格教育及儒雅氣質，營造友善校園環境，提升教學品質，凝聚以「溫馨、博雅、優質、活力、科學」為學校發展願景。